Считается, что храм Иоанна Богослова на Бронной появился еще в 1587 году. Но официальным годом строительства признан все-таки 1652.
В 1652 церковь на Бронной перестроили в камне. Вскоре там появилась богадельня, открылась православная школа (первое частное учебное заведение Москвы). А в 1740 к храму пристроили колокольню в стиле классицизм. На ней было 7 колоколов. Один из них в 1692 году отлил известный мастер Иван Моторин.
В церкви Иоанна Богослова на Бронной в 1812 году крестили родившегося в доме неподалеку Александра Герцена. А к 1917 храм превратился в целый комплекс с домами священнослужителей, церковных работников, собственным кладбищем и помещениями для сдачи в наем.
После революции работники расположенного рядом Камерного театра предложили снести церковь, чтобы освободить земли для театральных нужд. За храм Иоанна Богослова вступился архитектор Сухов, но в 1933 году здание перешло театру. Алтарь уничтожили, барабаны — разобрали, росписи — замазали, ценности — разграбили. На месте храмовой ограды поставили гараж.
Например, шурф для исследования фундамента храма нередко наполняла вода, что привело к появлению трещин на стенах. Не удивительно, что к 1991 году состояние храма было удручающим.
Церковь Иоанна Богослова вернули верующим. В 2003 году завершилась ее многолетняя реставрация, а в 2008 восстановили колокольню. Храм действует.