Одно время сюда устраивали настоящие паломничества, так как на церковном кладбище храма Ильи Пророка похоронили московского юродивого Корейшу.
Крещенный татарин, Илья Озаков был приближенным митрополита Алексия, поэтому завещал Черкизово Чудову монастырю. Живописное расположение села пришлось по душе митрополиту, и он сделал храм летней резиденцией московских патриархов.
Каменную церковь построили в 1689-1690 годах и дважды перестраивали: в 1821-1825 храм стал пятиглавым, а в конце 1890-х его перестроили по проекту Егорова и дополнили колокольней.
В 1861 году здесь похоронили знаменитого московского юродивого Ивана Корейшу. Его почитали как святого и даже запечатлели на страницах книг «Маленькая ошибка» Н.С. Лескова и «Бесы» Ф.М. Достоевского.
В годы Великой Отечественной войны верующие и духовенство храма Ильи Пророка в Черкизово собрали 1 миллион рублей на сооружение самолетов и отправили их Сталину. Он ответил благодарственной телеграммой. Возможно, поэтому храм не закрыли, хотя под ним планировали вести линию метро. Метростроевцы признавались, что тоннель уже прокладывали, но пришел приказ «свыше», и ветку пришлось повернуть в сторону. Поэтому поезда метро резко тормозят на середине пути от станции «Преображенская площадь» к «Черкизовской».
А в середине XX века в храм Ильи Пророка в Черкизове свозили иконы из разбираемых церквей.