Этот храм очень любили Мусины-Пушкины, он даже стал их родовой усыпальницей. А в 1930 году Борисоглебскую церковь разрушили. На ее месте построили наземный вестибюль станции метро Арбатская. От храма остался только памятный знак.
Новую часовню Бориса и Глеба построили в 1997 году в рекордно короткие сроки — чуть ли не за месяц. Автором проекта стал Юрий Вылегжанин. Средства на возведение храма выделило Министерство Обороны.
То место, которое выбрали для часовни — очень святое, ранее там находился храм Тихона, тоже снесенная ранее церковь. И было решено, что если мы создаем одну часовню Бориса и Глеба, то, само собой разумеется, мы должны как-то запечатлеть и снесенный храм Тихона. Поэтому нами было найдено решение, один из приделов часовни будет приделом Тихона. Размер часовни увеличился. В связи с этим получилась церковь-часовня или храм-часовня. Она будет действующей. Раз мы строим часовню, то пусть это будет храм-часовня, и пусть она будет на два метра шире. От этого возможность для службы в ней будет более удобной и для священнослужителей, и непосредственно для мирян. Тем более, на Арбатской площади мало действующих церквей, а плотность населения большая. И лишние два-три метра в площади пойдут только на пользу.
И хотя часовню поставили в память о снесенном храме Бориса и Глеба, по странному совпадению она появилась на правительственной трассе именно тогда, когда у Бориса Ельцина родился внук Борис.