История этой церкви связана с перенесением мощей святителя Филиппа в XVII веке.
Именно тогда на этом месте в Мещанской слободе царь Алексей Михайлович встречал мощи святителя Филиппа, перенесенные из Соловецкого монастыря в Москву. Затем их повезли в Успенский собор Кремля, а место встречи решили сохранить в церковной истории и установили деревянный крест. В 1677 году построили деревянную церковь во имя святителя Филиппа.
В 1691 обветшавшее здание перестроили в камне. А в 1788 году возвели новый каменный храм святителя Филиппа по проекту Матвея Казакова. При этом зодчий оставил без изменения колокольню и трапезную XVIII века.
В советское время церковь закрыли. В основном здании разместились государственные учреждения, а остальные постройки церковного ансамбля снесли.
Сейчас храм святителя Филиппа действует вновь.
...нижнюю часть иконостаса храма святителя Филиппа выполнил сам Матвей Казаков.
