Преображенское тесно связано с именем Петра I. Здесь базировались потешные войска, из которых сформировались Преображенский и Семеновский полки. А Преображенский храм был их полковой церковью.
Вскоре он стал любимым местом пребыванием царя. А после смерти Алексея Михайловича дворец в Преображенском стал постоянным жильем Натальи Кирилловны с маленьким Петром и дочерью Натальей.
В 1684 году по желанию Петра на левом берегу Яузы построили потешный городок — земляную крепость Прешбург с деревянными частями, рвом и высокой башней с часами. Здесь проходили маневры потешных войск, здесь же спустился на воду найденных в амбарах Измайлова парусный бот — ботик Петра, «дедушку русского флота».
В 1692 году Моисей Буженинов построил новые хоромы для государя. Но затем дворец в Преображенском пришел в запустение, и в начале XIX века его разобрали. А Преображенское к тому времени стало известно как «солдатская Преображенская слобода».
В 1747 году сержант Иван Третьяков купил в соседнем Семеновском здание старой деревянной церкви и перенес его в Преображенское. Храм освятили как церковь Петра и Павла в честь небесных покровителей Петра I. В 1768 году его перестроили, а на месте жертвенника церкви петровского времени установил памятный знак.
Во время пожара 1812 года храм не пострадал, службы там не прекращались все время пребывания в Москве французской армии.
После революции храм Петра и Павла действовал. Его прихожане не позволили даже снять колокола. Кроме того, сюда свозили святыни из разрушенных церквей. А в марте 1963 года Мосгорисполком решил снести Преображенскую церковь в связи со строительством метро. Прихожане встали на защиту храма: писали письма Хрущеву, собирали подписи, ходили в Мосгорисполком. Но в 1964 году храм Петра и Павла взорвали, а ветка метро прошла в стороне.
В 2015 году Преображенскую церковь восстановили, а у ее стен поставили памятник солдатам и офицерам-«преображенцам», погибшим в войнах за Отечество. Теперь это главный храм Сухопутных войск Российской Федерации.
...храм Преображения стал последним храмом, взорванным в СССР. Но на самом деле в апреле 1972 года в Москве взорвали храм Казанской Божьей Матери у Калужских ворот.