Считается, что этот храм заложили в честь рождения Петра I. Его щедро украсили полихромными изразцами работы Степана Полубеса. Поэтому собор Покрова Пресвятой Богородицы по праву считают главным украшением Измайловского острова.
Церковь получилась впечатляющей: высота центральной главы храма сравнима с шестиэтажным домом. Украшенная снаружи сказочными изразцами, она скромна внутри. Лишь иконостас, который оформили лучшие мастера Кремля, живописцы и резчики Ярославля и Костромы, напоминал о том, что церковь стоит в царской усадьбе.
В XIX веке Покровский собор превратился в домовый храм при богадельне инвалидов войны 1812 года, которую построили в Измайлово.
В советское время в Покровской церкви устроили овощехранилище. Тогда уничтожили иконостас, а на иконах, как на полках, хранили фрукты. В 1960-е образа отдали в Музей древнерусского искусства имени Андрея Рублева. В 1970-1980-х в Покровском соборе был склад НИИ «Информэлектро», а затем концертный зал.
Покровский храм на Измайловском острове вновь действует с 1990-х годов. Ему вернули немногие уцелевшие иконы, а в 2002 году создали новый иконостас.
