Не известно, как появилось название «Заяицкое» (так раньше именовали Раушскую набережную). Возможно, от яицких казаков, обосновавшихся здесь в Смутное время, или по имени царского иконописца Заяицого. Говорят даже, что название местности дала икона с Заяицкого острова Соловецкой обители. Сейчас о прежнем имени напоминает лишь барочная церковь.
Первую каменную слободскую церковь на этом месте построили вместо деревянной еще в 1652 году. В 1741 ее перестроили на средства купцов Москвиных и Турчаниновых, но в 1742 году недостроенное здание обрушилось.
После этого работы то возобновлялись, то останавливались, но все же новое здание церкви Николая Чудотворца в Заяицком завершили. Некоторые декоративные элементы все же не доделали: капители на фасаде остались гладкими — без запланированной резьбы. Храм окружила изящная ограда и кованая решетка с рисунком распускающегося цветочного бутона. Но она сохранилась лишь частично.
В 1933 году Никольский храм закрыли. Он перешел в ведение соседней электростанции. Купол и верхние ярусы колокольни разобрали. Здание планировали снести, но в итоге превратили в трансформаторно-механический цех. Храмовую икону «Преображение» конца XV века передали в Государственную Третьяковскую галерею.
В 1992 году в доме причта возобновились богослужения. Сейчас восстановлен и сам храм.